La asignatura de Química Orgánica II es un curso de estudios específicos, que se encuentra ubicado en el IV semestre de la malla curricular de la Carrera Profesional de Farmacia y Bioquímica, es de naturaleza teórico-práctica, de carácter obligatorio y se desarrolla en el segundo año de estudios.
La asignatura de Química Orgánica II proporciona al estudiante de Farmacia y Bioquímica los conocimientos fundamentales de la espectroscopia, la estructura de los compuestos orgánicos de manera tridimensional, los isómeros e importancia de los mismos cuando forman parte del cuerpo humano o interactúan con el mismo. Se estudian las moléculas en relación a sus grupos funcionales.